Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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