Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Map3k1P53349 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Map3k1P53349 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Map3k1P53349 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms