Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ApodP51910 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ApodP51910 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ApodP51910 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ApodP51910 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ApodP51910 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ApodP51910 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ApodP51910 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ApodP51910 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ApodP51910 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ApodP51910 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ApodP51910 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ApodP51910 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ApodP51910 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ApodP51910 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ApodP51910 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApodP51910 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApodP51910 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApodP51910 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApodP51910 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApodP51910 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApodP51910 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApodP51910 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApodP51910 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApodP51910 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApodP51910 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ApodP51910 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ApodP51910 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms