Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms