Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpc4P51655 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms