Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XpcP51612 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XpcP51612 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XpcP51612 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XpcP51612 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XpcP51612 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XpcP51612 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XpcP51612 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XpcP51612 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XpcP51612 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpcP51612 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XpcP51612 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XpcP51612 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XpcP51612 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XpcP51612 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XpcP51612 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
XpcP51612 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XpcP51612 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
XpcP51612 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XpcP51612 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XpcP51612 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XpcP51612 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XpcP51612 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XpcP51612 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XpcP51612 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XpcP51612 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XpcP51612 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpcP51612 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpcP51612 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpcP51612 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpcP51612 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpcP51612 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpcP51612 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpcP51612 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpcP51612 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpcP51612 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpcP51612 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XpcP51612 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XpcP51612 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XpcP51612 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XpcP51612 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XpcP51612 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XpcP51612 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XpcP51612 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XpcP51612 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XpcP51612 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XpcP51612 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpcP51612 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpcP51612 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpcP51612 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpcP51612 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpcP51612 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpcP51612 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpcP51612 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpcP51612 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpcP51612 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XpcP51612 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XpcP51612 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XpcP51612 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XpcP51612 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XpcP51612 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XpcP51612 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XpcP51612 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XpcP51612 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XpcP51612 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XpcP51612 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XpcP51612 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XpcP51612 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XpcP51612 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XpcP51612 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XpcP51612 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XpcP51612 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms