Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt6aP50446 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt6aP50446 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt6aP50446 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt6aP50446 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt6aP50446 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt6aP50446 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6aP50446 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms