Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms