Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc13P50207 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms