Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcls1P49710 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms