Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VdrP48281 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VdrP48281 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VdrP48281 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VdrP48281 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VdrP48281 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VdrP48281 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VdrP48281 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VdrP48281 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VdrP48281 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VdrP48281 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VdrP48281 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VdrP48281 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VdrP48281 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VdrP48281 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VdrP48281 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VdrP48281 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VdrP48281 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VdrP48281 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VdrP48281 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VdrP48281 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VdrP48281 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VdrP48281 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VdrP48281 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VdrP48281 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VdrP48281 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VdrP48281 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VdrP48281 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VdrP48281 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VdrP48281 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VdrP48281 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VdrP48281 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms