Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl5P47962 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms