Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccr7P47774 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr7P47774 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms