Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax9P47242 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax9P47242 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax9P47242 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.7 ms