Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax7P47239 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax7P47239 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax7P47239 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax7P47239 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pax7P47239 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms