Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab11bP46638 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms