Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt1P46096 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt1P46096 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt1P46096 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms