Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnfsf4P43488 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms