Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LifrP42703 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LifrP42703 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LifrP42703 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LifrP42703 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LifrP42703 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LifrP42703 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LifrP42703 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LifrP42703 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LifrP42703 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LifrP42703 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LifrP42703 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LifrP42703 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LifrP42703 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LifrP42703 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LifrP42703 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LifrP42703 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LifrP42703 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LifrP42703 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LifrP42703 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LifrP42703 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LifrP42703 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LifrP42703 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LifrP42703 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LifrP42703 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LifrP42703 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LifrP42703 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LifrP42703 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LifrP42703 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LifrP42703 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LifrP42703 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LifrP42703 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LifrP42703 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LifrP42703 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LifrP42703 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LifrP42703 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LifrP42703 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LifrP42703 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LifrP42703 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LifrP42703 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LifrP42703 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LifrP42703 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LifrP42703 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LifrP42703 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LifrP42703 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LifrP42703 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LifrP42703 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LifrP42703 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LifrP42703 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LifrP42703 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LifrP42703 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LifrP42703 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LifrP42703 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LifrP42703 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LifrP42703 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LifrP42703 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LifrP42703 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LifrP42703 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LifrP42703 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms