Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkx2-2P42586 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms