Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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