Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl28P41105 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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