Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox7P40646 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox7P40646 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox7P40646 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox7P40646 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms