Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp3P39876 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp3P39876 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms