Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TtlP38585 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TtlP38585 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TtlP38585 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TtlP38585 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TtlP38585 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TtlP38585 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TtlP38585 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtlP38585 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtlP38585 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtlP38585 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtlP38585 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtlP38585 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtlP38585 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtlP38585 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtlP38585 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtlP38585 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtlP38585 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtlP38585 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtlP38585 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtlP38585 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtlP38585 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtlP38585 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtlP38585 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtlP38585 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtlP38585 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtlP38585 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtlP38585 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtlP38585 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtlP38585 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtlP38585 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtlP38585 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtlP38585 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtlP38585 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtlP38585 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms