Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc5P35689 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc5P35689 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms