Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab17P35292 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab17P35292 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms