Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3dP35276 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3dP35276 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms