Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htr2cP34968 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htr2cP34968 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms