Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola1P33609 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola1P33609 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola1P33609 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pola1P33609 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pola1P33609 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pola1P33609 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pola1P33609 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola1P33609 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola1P33609 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pola1P33609 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pola1P33609 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola1P33609 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms