Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms