Protein–RNA interactions for Protein: P32972

Tnfsf8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf8P32972 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf8P32972 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf8P32972 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms