Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f3P31361 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f3P31361 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f3P31361 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms