Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms