Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa2P31245 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms