Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd28P31041 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms