Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms