Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Col2a1P28481 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col2a1P28481 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col2a1P28481 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Col2a1P28481 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col2a1P28481 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col2a1P28481 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col2a1P28481 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Col2a1P28481 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col2a1P28481 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col2a1P28481 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col2a1P28481 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col2a1P28481 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Col2a1P28481 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Col2a1P28481 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Col2a1P28481 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col2a1P28481 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col2a1P28481 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Col2a1P28481 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Col2a1P28481 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col2a1P28481 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col2a1P28481 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms