Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb3P28231 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms