Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vav1P27870 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vav1P27870 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vav1P27870 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vav1P27870 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vav1P27870 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vav1P27870 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vav1P27870 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vav1P27870 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms