Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CenpbP27790 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenpbP27790 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms