Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lef1P27782 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lef1P27782 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lef1P27782 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms