Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms