Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp4P21275 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp4P21275 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms