Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb9P20615 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms