Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SagP20443 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SagP20443 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SagP20443 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SagP20443 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SagP20443 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SagP20443 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SagP20443 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SagP20443 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SagP20443 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SagP20443 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SagP20443 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SagP20443 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SagP20443 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SagP20443 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SagP20443 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SagP20443 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SagP20443 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SagP20443 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SagP20443 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SagP20443 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SagP20443 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SagP20443 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SagP20443 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SagP20443 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SagP20443 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SagP20443 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SagP20443 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SagP20443 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SagP20443 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SagP20443 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SagP20443 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SagP20443 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SagP20443 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SagP20443 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SagP20443 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SagP20443 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SagP20443 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SagP20443 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SagP20443 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SagP20443 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms