Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ntf3P20181 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms