Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P20040 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P20040 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P20040 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P20040 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P20040 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P20040 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P20040 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P20040 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P20040 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P20040 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P20040 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P20040 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P20040 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P20040 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P20040 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms