Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a1P19437 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a1P19437 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms