Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefhP19246 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefhP19246 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefhP19246 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefhP19246 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NefhP19246 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefhP19246 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefhP19246 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefhP19246 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefhP19246 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefhP19246 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefhP19246 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefhP19246 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NefhP19246 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NefhP19246 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NefhP19246 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefhP19246 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefhP19246 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefhP19246 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefhP19246 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefhP19246 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefhP19246 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefhP19246 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefhP19246 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefhP19246 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefhP19246 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefhP19246 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefhP19246 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefhP19246 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefhP19246 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefhP19246 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NefhP19246 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NefhP19246 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NefhP19246 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NefhP19246 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NefhP19246 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NefhP19246 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NefhP19246 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NefhP19246 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NefhP19246 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NefhP19246 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NefhP19246 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NefhP19246 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NefhP19246 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NefhP19246 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NefhP19246 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NefhP19246 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NefhP19246 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NefhP19246 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NefhP19246 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NefhP19246 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NefhP19246 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NefhP19246 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NefhP19246 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NefhP19246 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NefhP19246 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NefhP19246 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NefhP19246 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NefhP19246 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NefhP19246 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NefhP19246 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NefhP19246 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NefhP19246 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NefhP19246 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NefhP19246 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NefhP19246 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NefhP19246 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NefhP19246 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NefhP19246 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NefhP19246 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NefhP19246 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NefhP19246 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NefhP19246 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms